El genoma del hantavirus se construyó a partir de 'sangre humana' en el Bioloab militar estadounidense

La secuencia del genoma del hantavirus de los Andes se ensambló en la infame instalación a partir de lecturas de secuenciación fragmentadas extraídas de sangre humana mediante software de ensamblaje informático y rellenos genómicos de referencia.

Modernity.news informa: La divulgación de financiación del periódico muestra que el trabajo de reconstrucción del genoma del hantavirus de Fort Detrick fue apoyado a través de los canales de financiación de biodefensa y enfermedades infecciosas del gobierno de EE. UU. vinculados a HHS/NIAID (HHSN272201800013C y HHSN272200700016I), incluyendo contratos relacionados con Battelle Memorial Institute y Laulima Government Solutions.

La financiación total potencial asignada a los dos contratos Fort Detrick/NIAID es de aproximadamente 387,5 millones de dólares.

Los registros muestran que científicos del Instituto de Investigación Médica del Ejército de los Estados Unidos (USAMRIID) recibieron físicamente muestras de sangre de supuestos pacientes con hantavirus y utilizaron esas muestras para generar la secuencia genómica que ahora se almacena en GenBank y cita en toda la literatura científica.

Esa misma secuencia del genoma del hantavirus de los Andes, construida por Fort Detrick, está siendo utilizada ahora por los investigadores como genoma de referencia para analizar y comparar secuencias relacionadas con el reciente brote de hantavirus de 2026 a bordo del crucero MV Hondius.

Esta conexión plantea grandes preguntas sobre si la detección moderna de brotes, la vigilancia genómica y los sistemas autoritarios de respuesta a pandemias se están construyendo cada vez más en torno a secuencias de referencia reconstruidas por ordenador generadas dentro de canales de investigación militar y de biodefensa, en lugar de aislados virales purificados secuenciados directamente.

Si las secuencias genómicas fundamentales que impulsan las pruebas PCR, el seguimiento de brotes, las políticas de cuarentena, los sistemas de vigilancia y el desarrollo de vacunas dependen en gran medida de la reconstrucción informática, la modelización estadística y el relleno de secuencias de referencia, más que de la secuenciación directa e ininterrumpida de aislados virales purificados, plantea profundas preguntas sobre si todo el marco de respuesta a la pandemia se está volviendo cada vez más circular y autorreferencial.

Lo que hace que el sistema sea potencialmente utilizable como arma, porque quien controla las secuencias de referencia, las canaletas computacionales y los estándares diagnósticos controla efectivamente la base sobre la que se detectan, modelan, declaran y responden los brotes.

Fort Detrick recibió muestras de sangre humana

El apéndice suplementario del artículo del NEJM afirma explícitamente: "Se incluyeron muestras de sangre entera de 28 (82% de 34) casos confirmados en laboratorio del brote de síndrome pulmonar de hantavirus causado por Epuyén ANDV en el análisis genómico."

Los investigadores añadieron: "El ARN se extrajo de 400 μl de sangre total..."

El apéndice también indica que las muestras fueron transferidas físicamente al sistema de biodefensa militar de Fort Detrick: "Las muestras fueron enviadas a USAMRIID bajo un acuerdo de transferencia de material (número de control MRMC: W81XWH-18-0469)..."

Esto significa que el genoma publicado del hantavirus se generó a partir de lecturas de secuenciación de ARN fragmentadas extraídas directamente de muestras mixtas de sangre humana manipuladas dentro de una tubería de biolaboratorio militar estadounidense.

Los científicos dicen que extrajeron material genético humano antes de construir el genoma

Los registros muestran que los científicos de Fort Detrick no secuenciaron directamente un genoma completo e ininterrumpido de hantavirus a partir de partículas virales purificadas.

En su lugar, el flujo de trabajo incluía:

• extrayendo material genético mezclado de sangre humana,
• eliminando computacionalmente las secuencias humanas,
• ensamblando secuenciación fragmentada se lee en piezas parciales del genoma llamadas contigs,
• y rellenar lagunas genómicas ausentes utilizando secuencias de referencia previamente publicadas de GenBank.

El apéndice indica explícitamente: "La eliminación del genoma humano y la lectura del transcriptoma humano se realizó posteriormente alineando las lecturas recortadas de calidad con la referencia del genoma humano GRCh38..."

Es decir, los científicos de Fort Detrick afirman haber filtrado primero material genético humano de los datos de secuenciación de sangre antes de ensamblar los fragmentos restantes en lo que se convirtió en el genoma publicado del hantavirus de los Andes.

Pero dado que el material original consistía en fragmentos de secuenciación mixtos derivados de sangre humana en lugar de un aislado viral purificado secuenciado directamente, el genoma final publicado aún dependía de la interpretación computacional, las decisiones de reconstrucción y los rellenos guiados por referencias para determinar qué se consideraba finalmente la secuencia del "hantavirus".

El genoma final publicado no se "leía" directamente de una partícula viral purificada.

Surgió a través de múltiples capas de filtrado controlado por ordenador, reconstrucción, llamada de consenso estadístico y parcheo de secuencias de referencia realizados dentro de la cadena bioinformática de Fort Detrick.

El genoma publicado se parcheaba usando secuencias de referencia

El apéndice explica cómo se ensambló el genoma: "Para generar genomas de consenso ANDV, se ensamblaron lecturas limpias de novo usando SPAdes..."

Sin embargo, los datos de secuenciación no produjeron genomas completos e ininterrumpidos directamente a partir de muestras de sangre de los pacientes.

En cambio, los investigadores reconocieron que las regiones ausentes del genoma debían rellenarse usando secuencias genómicas previamente publicadas: "Los huecos y extremos de los contigs incompletos se rellenaron con secuencias de segmentos genómicos cercanos y completos de GenBank..."

Es decir, partes del genoma final publicado del hantavirus se ensamblaron utilizando secuencias genómicas de referencia antiguas donde los datos de secuenciación directa faltaban o eran incompletos.

El apéndice indica además: "Solo se usaron bases con una puntuación de calidad Phred >Q20 y un mínimo de cobertura 3X" para la llamada de consenso."

La llamada de consenso es un proceso informático que genera una secuencia genómica "más adecuada" a partir de lecturas fragmentadas de secuenciación tras filtrar, alinear y reconstruir.

Si partes del genoma publicado del hantavirus faltaban y tenían que rellenarse con secuencias de referencia antiguas, ¿cuánto del genoma final se secuenciaba directamente de la sangre del paciente y cuánto era reconstrucción generada por ordenador?

Algunos segmentos del genoma faltaban más de la mitad

Los registros revelan además que algunos ensamblajes genómicos estaban sustancialmente incompletos antes de que se aplicaran reestructuraciones y rellenos de referencia.

La tabla S3 muestra únicamente el segmento L de un paciente alcanzado: cobertura "3080/6562 [46,94%]"

Esto significa que faltaba más de la mitad de ese segmento genómico antes de que se usaran reconstrucciones adicionales y rellenos de genoma de referencia para completar la secuencia publicada.

Otras muestras de pacientes alcanzaron una cobertura mucho mayor, con muchas que se acercan al 99%, pero el apéndice confirma que los contigs incompletos y las regiones genómicas ausentes eran una parte recurrente del flujo de trabajo de ensamblaje.

Esto significa que partes del genoma publicado del hantavirus no se secuenciaron directamente a partir de material del paciente, sino que se reconstruyeron computacionalmente y se parchearon donde faltaban los datos genómicos originales.

Esto plantea grandes dudas sobre la precisión y fiabilidad del genoma final publicado, ya que faltaban partes significativas de algunas secuencias y luego se reconstruyeron mediante rellenos de referencia informáticos en lugar de secuenciar directamente a partir de material del paciente.

Los cebadores de PCR también coincidieron con material genético humano

La importancia de los hallazgos se vuelve aún mayor si se comparan con análisis recientes de BLAST que muestran que los cebadores de PCR y sondas fluorescentes publicados por hantavirus coincidían repetidamente con material genético humano.

Según el análisis: "partes de las secuencias genéticas utilizadas por la prueba PCR para supuestamente detectar el hantavirus también coinciden directamente con secuencias de ADN humano."

El informe documentado repetía:

• 19/19 coincidencias exactas,
• 20/20 coincidencias exactas,
• 18/18 coincidencias exactas,
• y numerosas coincidencias exactas 17/17 entre los componentes de la PCR del hantavirus y las regiones genómicas humanas.

La propia sonda de detección fluorescente —el componente responsable de generar la señal PCR "positiva"— también produjo coincidencias repetidas de ADN humano exactas y casi exactas.

Los hallazgos resultan especialmente significativos a la luz del flujo de trabajo de Fort Detrick, que a su vez comenzó con muestras mixtas de sangre humana y requirió una resta computacional de material genético humano antes de que se ensamblara el genoma.

La superposición plantea preguntas evidentes sobre la confianza con la que el sistema PCR podía distinguir el material genético supuesto de hantavirus del material genético humano cuando el genoma de referencia publicado se reconstruyó a partir de datos mixtos de secuenciación de sangre humana.

Documentos de DARPA revelan el marco del Pentágono para secuencias virales solo digitales

El flujo de trabajo de reconstrucción del hantavirus de Fort Detrick también se alinea con documentos previamente publicados por DARPA que describen sistemas respaldados por el Pentágono diseñados para funcionar incluso cuando: "solo puede estar disponible información de secuencias virales electrónicas."

Los registros de DARPA describen sistemas diseñados para:

• tomar secuencias del genoma digital,
• sintetizar genomas clonados infecciosos,
• propagar virus en sistemas celulares,
• y convertir rápidamente secuencias genéticas cargadas en contramedidas de ARNm.

La plataforma está pensada para funcionar incluso cuando no existe un virus físico, solo un archivo informático.

Los archivos indican: "Porque reconocemos la posibilidad de que durante un brote pandémico solo pueda estar disponible información de secuencias virales electrónicas..."

La entrada de GenBank confirma el origen sanguíneo humano del genoma del hantavirus

La entrada de GenBank vinculada al brote confirma de forma independiente el material biológico de origen utilizado para generar el genoma publicado.

La entrada dice: /isolation_source="sangre entera"

Los metadatos GenBank también enumeran la cadena de ensamblaje informática utilizada para generar el genoma:

• Ray
• Pajarita2
• Picard
• Prinseq-lite
• Cutadapt
• Secuenciación Illumina

El apéndice del NEJM y los registros de GenBank no describen:

• purificación de partículas virales intactas,
• Aislamiento de placas,
• Purificación de cultivos virales antes de la secuenciación,
• o secuenciación directa de viriones purificados.

En cambio, los registros muestran que el genoma publicado del hantavirus de los Andes se ensambló en Fort Detrick a partir de lecturas de secuenciación fragmentadas extraídas de sangre humana tras la eliminación computacional del material genético humano y el relleno de las regiones genómicas faltantes utilizando secuencias genómicas de referencia previamente publicadas.

Conclusión

Los registros muestran un marco de biodefensa y respuesta a brotes cada vez más centrado en secuencias genómicas reconstruidas computacionalmente generadas a partir de material biológico fragmentado mezclado y complementadas mediante canales de ensamblaje guiados por referencia, en lugar de secuenciación directa e ininterrumpida de partículas virales purificadas.

Esos genomas de consenso ensamblados por ordenador se convierten entonces en la base para:

• Pruebas PCR,
• Modelado filogenético,
• mapeo de transmisión,
• cálculos de números reproductivos,
• Seguimiento de brotes,
• Políticas de cuarentena,
• sistemas de vigilancia,
• y desarrollo de contramedidas de vacunas o ARNm.

En otras palabras, los mismos constructos genómicos generados por ordenador ensamblados mediante algoritmos de filtrado, rellenos de secuencias de referencia y modelado estadístico de consenso se tratan posteriormente como la base biológica autorizada de toda la infraestructura de respuesta a brotes.

Ahora, ese marco se está utilizando para justificar los mensajes de los medios convencionales y las medidas autoritarias de cuarentena impuestas por los gobiernos a los pasajeros del Hondius.

Fuente: The Peoples voice